禊から生まれた三貴子——右目から生まれた月の神
伊邪那岐命が黄泉の穢れを流すために禊を行った際、左目を洗ったとき天照大神が、右目を洗ったとき月読命が、鼻を洗ったとき素戔嗚尊が生まれた。伊邪那岐命はこの三柱を「三貴子（みはしらのうずのみこ）」と呼んで特別に愛した。天照大神には高天原（天界）を、月読命には「夜の食国（よるのおすくに）」を、素戔嗚尊には海原を治めるよう命じた。天照大神が太陽・昼の世界を、月読命が月・夜の世界を治めるという、昼と夜の神聖な二分法が定まった瞬間である。古事記はここで月読命に関する記述をほぼ終える。

保食神を殺した月読命——昼と夜が分かれた原因
日本書紀（一書）に記されるエピソード。天照大神から「保食神（うけもちのかみ、食物の神）のもとへ行って様子を見よ」と遣わされた月読命は、保食神を訪問した。保食神は月読命をもてなすために、口から様々な食べ物（米・魚・獣）を取り出して供した。しかし月読命はこの振る舞いを「汚らわしい」と怒り、剣を抜いて保食神を殺してしまった。天照大神はこれを聞いて「月読命は悪しき神だ。もう会いたくない」と宣言した。以来、天照大神と月読命は昼と夜に分かれて顔を合わせなくなったとされ、これが「昼と夜が交互に来る」という自然の摂理の起源とされる。なお古事記では素戔嗚尊の乱暴が天照大神の岩屋隠れの原因となるのと対比的な話である。

保食神の体から生まれた五穀——農耕の起源
月読命に殺された保食神の体からは、五穀をはじめとするさまざまな農作物・家畜が生まれた。頭から牛馬が、額から粟（あわ）が、眉から蚕（かいこ）が、目から稗（ひえ）が、腹から稲が、陰部から麦・大豆・小豆などが生まれたとされる。天照大神はこれらを「人が食べるべき物」として農耕の始まりとした。月読命が保食神を殺したことは一見残酷なエピソードに見えるが、この「死から農作物が生まれる」というモチーフは、伊邪那美命が火の神を生んで死に新たな神が生まれたエピソードと同様の「死と創造の連鎖」というテーマを持つ。月読命は意図せず日本の農耕文明の起源を作った神でもある。

壱岐の月読神社——月読命が最初に鎮まった島
長崎県壱岐島（いきのしま）に鎮座する月読神社は、全国の月読社の総本社とされる。古事記・日本書紀には壱岐の直という人物が月読命のお告げを受けて神社を建てた、という伝承が記され、この壱岐島こそが月読命信仰の発祥地とされる。壱岐島はかつて「月島（つきのしま）」とも呼ばれ、月読命との深い縁を持つ。対馬海峡に位置する壱岐島は古代から大陸との交流の要衝であり、月（暦・潮汐）を読む技術が航海・農耕に欠かせなかった海の民の信仰と月読命が結びついていった。